南通市住房公積金管理中心是市政府直屬的負責全市行政區域內住房公積金的管理運作的事業單位。主要職責為：

 一、編制、執行住房公積金的歸集、使用計劃；

 二、負責記載住房公積金的繳存、提取、使用等情況；

 三、負責住房公積金的核算；

 四、審批住房公積金的提取、使用；

 五、負責住房公積金的保值、增值和歸還；

 六、編制住房公積金歸集、使用計劃執行情況的報告；

 七、負責對住房公積金經辦銀行業務上的管理；

 八、承辦住房公積金管理委員會決定的其他事項。